Женское Объединение ЭМЦ было создано 6 ноября 1993 года, благодаря посещению Лии Лиллеоя и Кюлли Куусемаа женской кон­ференции Британской Методистской Церк­ви, проходящей в Англии в июне 1991 года. Одновременно налаживались контакты с Ме­тодистской Международной Женской Феде­рацией Континентально-Европейского регио­на. На одном из семинаров, проходящих в апреле 1989 года, в Восточной Германии, Меели Танклер представляла ЭМЦ.

Методистская и Всемирная Женская Фе­дерация Объединённых Церквей (World Fede­ ration of Methodist and Uniting Church Women) – это организация, объединяющая женщин- методистов более чем из 70 стран со всего мира. Женское Объединение ЭМЦ восстановило своё членство в этой организации в 1996 году. В действительности женщины ЭМЦ были формально в числе основателей этой федерации, так как 26 октября 1939 года, в Америке в Пасадене, жена епископа Раймонда Джей Вейда включила в список об Основа­нии Методистской Всемирной Женской Фе­- дерации помимо Швеции, Финляндии, Фин­ляндии-Швеции, Латвии и Литвы и имена женщ ин ЭМЦ. Когда были закрыты границы, не было возможности официально заниматься женской работой в церкви, а тем более, об­щаться на международном уровне.

Было установлено 4 направления работы: христианское благовестие, общение, изучение и душепопечительство. На служениях Женс­кого Объединения говорилась весть, исходящая из сердца. В группах общения уделяется большое значение молитве, исследованию Библии и общению между собой. Различные семинары предлагали возможности обучения, также за их деятельностью можно было проследить через журнал «Кодутеел». Были налажены хорошие экуменические контакты с различными конфессиями и работа удостоилась международного признания. По инициативе женщин ЭМЦ были организо­ваны Всемирные Женские Молитвенные Дни, где ежегодно в первую пятницу марта про­ходили экуменические богослужения. Уже 10 лет, как они проходят в Таллинне и Пярну, в 2006 году к этому списку присоединились Сааремаа, Раквере и Ида-Вирумаа. Женское Объединение состоит из женщин, как из эстонских, так и из русских церквей. Не смотря на то, что основная деятельность проходит в поместных церквях, ежегодно проходят два общих мероприятия со всей Эстонии: 1 – Ве­ сенний или Летний День; и 2 – День ожидания Рождества.

Каждые 3 года, в ноябре, собирается со­вет, который избирает новый состав. Пред­ седателями Женского Объединения ЭМЦ бы­ли в 1-ый и 3-ий период Лий Лиллеоя, во 2-ой период – Майре Симм, в 4-ый период – Меели Танклер и в 5-ый период Пилле Мягила. В состав руководства входят 6 членов. На дан­ный момент, 5 ноября 2005 года, избран следующий состав: Имби Херм, Сирли Лахи, Валентина Пыльд, Людмила Волчихина, Вёёбе Уус и председатель Пилле Мягила.

Большим признанием для ЭМЦ было избра­ние одного из основателей Женского Объе­ динения Меели Танклер заместителем пре­зидента (1996–2001) Методистской Междуна­ родной Женской Федерацией Континентально Европейского региона и президентом (2001– 2006), а также координатором по Эстонии Европейского Экуменического Христианского Женского Форума в ноябре 2006 года.